方最初的反应是强硬而轻蔑的。负责陆沉舟案的检察官在内部会议上，将方启明提交的意见书斥为“毫无根据的猜测”、“拖延诉讼的技巧”、“对司法机关专业能力的侮辱”。他们坚持认为，现有证据链条完整，鉴定程序合法，所谓“数字指纹”不过是辩方聘请的“江湖黑客”炮制的、无法验证的玄学把戏，企图混淆视听。对于重新鉴定的申请，更是以“案件事实清楚、证据确实充分，无重新鉴定必要”为由，直接驳回。
更令人不安的是，方启明和秦墨不约而同地感受到了一股无形的压力。他们试图接触的几位鉴定专家，或是以“案件敏感”、“已有委托”为由婉拒，或是通话时态度暧昧、顾左右而言他，甚至有人在约定见面时间前突然“身体不适”或“临时出差”。方启明团队内部，也开始出现一些不和谐的声音，有年轻律师担心此案背后水太深，恐影响职业生涯；秦墨则收到了几条来源不明的短信，暗示她“适可而止”、“为自己考虑”。
一切迹象都表明，“母亲”的触手早已渗透到司法体系的各个层面，尤其是在专业性极强、门槛极高的电子证据鉴定领域。她似乎在编织一张密不透风的网，试图将阿九发现的真相，扼杀在摇篮里。
“不能坐以待毙。”方启明在又一次碰壁后，对团队核心成员沉声道，“常规路径走不通，我们就走非常路径。证据的真实性，是本案的生命线。如果连鉴定真相的渠道都被堵死，那法律就真的成了摆设。”
他决定双管齐下。一方面，利用自己在学界和实务界的影响力，通过公开的学术研讨会、内部专家论证会等形式，以探讨“电子证据时代新型伪造手段与司法应对”为议题，将本案中暴露出的、具有代表性的“数字指纹”疑点（隐去具体案件信息）抛出来，引发学术界和实务界对电子证据审查标准的大讨论，制造舆论压力和专业共识。另一方面，他将目光投向了境外。他通过国际律师协会的渠道，秘密联系了欧洲和美国几位在电子证据取证和反伪造领域享有国际声誉、且以独立性和职业道德著称的专家，试探他们是否愿意接受委托，对涉案电子证据进行“影子鉴定”（即非官方的、独立的第三方技术分析），并出具专家意见。虽然“影子鉴定”的报告在中国法庭上不能直接作为证据使用，但其权威结论，足以对承办法官产生巨大的心理影响，也能成为辩方申请重新鉴定的有力背书。
秦墨则走了一条更接地气的路线。她不再执着于寻找那些早已名声在外的“权威”，而是将目光投向了高校和科研院所的实验
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